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"La virulence d'Omicron est proche de celle de la grippe saisonnière" et "Omicron est nettement moins pathogène que Delta".…… Récemment, de nombreuses informations sur la virulence de la nouvelle souche mutante de la couronne Omicron se sont répandues sur Internet.
En effet, depuis l'émergence de la souche mutante Omicron en novembre 2021 et sa prévalence mondiale, les recherches et les discussions sur la virulence et la transmission se sont poursuivies sans relâche.Quel est le profil de virulence actuel d'Omicron ?Que dit la recherche à ce sujet ?
Diverses études en laboratoire : Omicron est moins virulent
En fait, dès janvier 2022, une étude de la faculté de médecine Li Ka Shing de l'Université de Hong Kong a révélé qu'Omicron (B.1.1.529) pourrait être moins pathogène que la souche d'origine et d'autres souches mutantes.
Il a été constaté que la souche mutante Omicron était inefficace dans l'utilisation de la sérine protéase transmembranaire (TMPRSS2), tandis que TMPRSS2 pouvait faciliter l'invasion virale des cellules hôtes en clivant la protéine de pointe du nouveau coronavirus.Dans le même temps, les chercheurs ont observé que la réplication d'Omicron était significativement réduite dans les lignées cellulaires humaines Calu3 et Caco2.
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Dans le modèle de souris k18-hACE2, la réplication d'Omicron était réduite dans les voies respiratoires supérieures et inférieures des souris par rapport à la souche d'origine et au mutant Delta, et sa pathologie pulmonaire était moins grave, tandis que l'infection à Omicron provoquait moins de perte de poids et de mortalité que la souche originale et les mutants Alpha, Beta et Delta.
Par conséquent, les chercheurs ont conclu que la réplication et la pathogénicité d'Omicron étaient réduites chez la souris.
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Le 16 mai 2022, Nature a publié un article de Yoshihiro Kawaoka, un virologue de premier plan de l'Université de Tokyo et de l'Université du Wisconsin, confirmant pour la première fois dans un modèle animal qu'Omicron BA.2 est en effet moins virulent que la souche originale précédente. .
Les chercheurs ont sélectionné des virus BA.2 vivants isolés au Japon pour infecter des souris et des hamsters k18-hACE2 et ont découvert qu'après infection avec la même dose de virus, les souris infectées par BA.2 et BA.1 avaient des titres de virus significativement plus faibles dans les poumons. et le nez que l'infection originale de la souche New Crown (p<0,0001).
Ce résultat de référence confirme qu'Omicron est en effet moins virulent que le type sauvage d'origine.En revanche, il n'y avait pas de différence significative dans les titres viraux dans les poumons et le nez des modèles animaux après les infections BA.2 et BA.1.
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Les tests de charge virale par PCR ont montré que les souris infectées par BA.2 et BA.1 avaient des charges virales dans les poumons et le nez inférieures à celles de la souche New Crown originale, en particulier dans les poumons (p<0,0001).
Comme pour les résultats chez la souris, les titres viraux détectés dans le nez et les poumons des hamsters infectés par BA.2 et BA.1 étaient inférieurs à ceux de la souche d'origine après "inoculation" avec la même dose de virus, en particulier dans les poumons, et légèrement plus bas dans le nez des hamsters infectés par BA.2 que BA.1 - en fait, la moitié des hamsters infectés par BA.2 n'ont pas développé d'infection pulmonaire.
Il a en outre été découvert que les souches originales, BA.2 et BA.1, manquaient de neutralisation croisée des sérums après l'infection, ce qui correspond à ce qui a été observé chez les humains du monde réel lorsqu'ils sont infectés par différents nouveaux mutants de la couronne.
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Données du monde réel : Omicron est moins susceptible de provoquer une maladie grave
Plusieurs des études ci-dessus ont décrit la virulence réduite d'Omicron dans des modèles animaux de laboratoire, mais est-ce la même chose dans le monde réel ?
Le 7 juin 2022, l'OMS a publié un rapport évaluant la différence de gravité des personnes infectées lors de l'épidémie d'Omicron (B.1.1.529) par rapport à la pandémie de Delta.
Le rapport comprenait 16 749 nouveaux patients coronariens hospitalisés de toutes les provinces d'Afrique du Sud, dont 16 749 de l'épidémie de Delta (2021/8/2 au 2021/10/3) et 17 693 de l'épidémie d'Omicron (2021/11/15 au 2022/2/ 16).Les patients ont également été classés comme graves, graves et non graves.
critique : avoir reçu une ventilation invasive, ou de l'oxygène et de l'oxygène transnasal à haut débit, ou une oxygénation par membrane extracorporelle (ECMO), ou une admission aux soins intensifs pendant l'hospitalisation.
-severe (sévère) : a reçu de l'oxygène pendant l'hospitalisation
- non sévère : si aucune des conditions ci-dessus n'est remplie, le patient est non sévère.
Les données ont montré que dans le groupe Delta, 49,2 % étaient graves, 7,7 % étaient critiques et 28 % de tous les patients hospitalisés infectés par Delta sont décédés, tandis que dans le groupe Omicron, 28,1 % étaient graves, 3,7 % étaient critiques et 15 % de tous les patients hospitalisés. Des patients infectés par Omicron sont décédés.De plus, la durée médiane de séjour était de 7 jours dans le groupe Delta contre 6 jours dans le groupe Omicron.
En outre, le rapport a analysé les facteurs d'influence de l'âge, du sexe, du statut vaccinal et des comorbidités et a conclu qu'Omicron (B.1.1.529) était associé à une probabilité plus faible de maladie grave et critique (IC à 95 % : 0,41 à 0,46 ; p <0,001) et un risque plus faible de décès à l'hôpital (IC à 95 % : 0,59 à 0,65 ; p<0,001).
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Pour les différents sous-types d'Omicron, d'autres études ont également analysé leur virulence en détail.
Une étude de cohorte de la Nouvelle-Angleterre a analysé 20770 cas de Delta, 52605 cas d'Omicron B.1.1.529 et 29840 cas d'Omicron BA.2, et a constaté que la proportion de décès était de 0,7% pour Delta, 0,4% pour B.1.1. 529 et 0,3% pour BA.2.Après ajustement pour tenir compte des facteurs de confusion, l'étude a conclu que le risque de décès était significativement plus faible pour BA.2 par rapport à Delta et B.1.1.529.
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Une autre étude d'Afrique du Sud a évalué le risque d'hospitalisation et le risque d'issue grave pour Delta, BA.1, BA.2 et BA.4/BA.5.Les résultats ont montré que sur les 98 710 patients nouvellement infectés inclus dans l'analyse, 3 825 (3,9 %) ont été admis à l'hôpital, dont 1 276 (33,4 %) ont développé une maladie grave.
Parmi les personnes infectées par les différentes mutations, 57,7 % des patients infectés par Delta ont développé une maladie grave (97/168), contre 33,7 % des patients infectés par BA.1 (990/2940), 26,2 % des patients BA.2 (167/168). 637) et 27,5 % de BA.4/BA.5 (22/80).L'analyse multivariée a montré que la probabilité de développer une maladie grave chez les personnes infectées Delta > BA.1 > BA.2, tandis que la probabilité de développer une maladie grave chez les personnes infectées BA.4/BA.5 n'était pas significativement différente par rapport à BA. 2.
Virulence réduite, mais vigilance nécessaire
Des études en laboratoire et des données réelles provenant de plusieurs pays ont montré qu'Omicron et ses sous-types sont moins virulents et moins susceptibles de provoquer des maladies graves que la souche d'origine et d'autres souches mutantes.
Cependant, un article de synthèse dans le numéro de janvier 2022 de The Lancet, intitulé "Milder but not mild", a noté que bien que l'infection à Omicron représentait 21% des hospitalisations dans la population sud-africaine plus jeune, la proportion d'épidémies causant une maladie grave était probablement augmenter dans les populations présentant différents niveaux d'infection et différents niveaux de vaccination.(Néanmoins, dans cette population sud-africaine généralement jeune, 21 % des patients hospitalisés infectés par le variant omicron du SRAS-CoV-2 ont eu une évolution clinique sévère, une proportion qui pourrait augmenter et avoir un impact substantiel lors d'épidémies dans des populations aux caractéristiques démographiques différentes et à faible les niveaux d'immunité dérivée d'une infection ou d'un vaccin.)
À la fin du rapport de l'OMS susmentionné, l'équipe a noté que malgré la virulence réduite de la souche précédente, près d'un tiers des patients hospitalisés d'Omicron (B.1.1.529) ont développé une maladie grave, et que les différents nouveaux mutants de la couronne ont continué à causent une morbidité et une mortalité élevées chez les personnes âgées, les populations immunodéprimées ou non vaccinées.(Nous voudrions également avertir que notre analyse ne doit pas être considérée comme soutenant le récit de la variante «légère». Près d'un tiers des patients hospitalisés d'Omicron ont développé une maladie grave et 15% sont décédés; des chiffres qui ne sont pas insignifiants ...... Parmi les populations vulnérables , c'est-à-dire les patients aux âges extrêmes, dans les populations à charge comorbide élevée, chez les patients fragiles et parmi les non vaccinés, le COVID-19 (tous les COV) continue de contribuer à une morbidité et une mortalité substantielles.)
Les données précédentes d'Omicron lors du déclenchement de la cinquième vague de la pandémie à Hong Kong ont montré qu'au 4 mai 2022, il y avait eu 9115 décès sur 1192765 cas nouvellement couronnés lors de la cinquième vague (un taux brut de mortalité de 0,76%) et un taux brut taux de mortalité de 2,70% pour les personnes de plus de 60 ans (environ 19,30% de cette tranche d'âge n'étaient pas vaccinés).
En revanche, seuls 2% des Néo-Zélandais de plus de 60 ans ne sont pas vaccinés, ce qui est fortement corrélé avec un faible taux brut de mortalité de 0,07% pour la nouvelle épidémie de couronne.
D'un autre côté, alors qu'on prétend souvent que Newcastle pourrait devenir une maladie saisonnière et endémique à l'avenir, certains experts universitaires ont un point de vue différent.
Trois scientifiques de l'Université d'Oxford et du Centre commun de recherche de l'Union européenne pensent que la plus faible gravité d'Omicron pourrait simplement être une coïncidence et que l'évolution antigénique rapide et continue (évolution antigénique) pourrait entraîner de nouvelles variantes.
Contrairement à l'évasion immunitaire et à la transmissibilité, qui sont soumises à une forte pression évolutive, la virulence n'est généralement qu'un « sous-produit » de l'évolution.Les virus évoluent pour maximiser leur capacité à se propager, ce qui peut également entraîner une augmentation de la virulence.Par exemple, en augmentant la charge virale pour faciliter la transmission, il peut encore provoquer une maladie plus grave.
Non seulement cela, mais la virulence causera également des dommages très limités lors de la propagation d'un virus si les symptômes provoqués par le virus apparaissent principalement plus tard dans l'infection - comme dans le cas des virus de la grippe, du VIH et de l'hépatite C, pour n'en nommer qu'un quelques-uns, qui ont tout le temps de se propager avant de provoquer de graves conséquences.
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Dans de telles circonstances, il peut être difficile de prédire la tendance de la nouvelle souche mutante couronne à partir de la plus faible virulence d'Omicron, mais la bonne nouvelle est que le nouveau vaccin couronne a démontré un risque réduit de maladie grave et de décès contre toutes les souches mutantes, et l'augmentation agressive des taux de vaccination de la population reste un moyen important de lutter contre l'épidémie à ce stade.
Remerciements : Cet article a été révisé professionnellement par Panpan Zhou, PhD, École de médecine de l'Université de Tsinghua et boursier postdoctoral, Scripps Research Institute, États-Unis
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Heure de publication : 08 décembre 2022