Dans quelle mesure la toxicité d'Omicron a-t-elle diminué ? De nombreuses études en conditions réelles le révèlent.

« La virulence d’Omicron est proche de celle de la grippe saisonnière » et « Omicron est significativement moins pathogène que Delta ». …… Récemment, de nombreuses nouvelles sur la virulence de la nouvelle souche mutante couronne Omicron se sont répandues sur Internet.

En effet, depuis l'émergence de la souche mutante Omicron en novembre 2021 et sa prévalence mondiale, la recherche et les discussions sur la virulence et la transmission se poursuivent sans relâche. Quel est le profil de virulence actuel d'Omicron ? Que disent les recherches à ce sujet ?

Diverses études en laboratoire : Omicron est moins virulent
En fait, dès janvier 2022, une étude de la faculté de médecine Li Ka Shing de l’université de Hong Kong a révélé qu’Omicron (B.1.1.529) pourrait être moins pathogène que la souche originale et d’autres souches mutantes.
Il a été constaté que la souche mutante Omicron était inefficace dans l'utilisation de la sérine protéase transmembranaire (TMPRSS2), tandis que TMPRSS2 pouvait faciliter l'invasion virale des cellules hôtes en clivant la protéine de pointe du nouveau coronavirus. Parallèlement, les chercheurs ont observé une réduction significative de la réplication d'Omicron dans les lignées cellulaires humaines Calu3 et Caco2.

Source de l'image Internet

Dans le modèle de souris k18-hACE2, la réplication d'Omicron a été réduite dans les voies respiratoires supérieures et inférieures des souris par rapport à la souche d'origine et au mutant Delta, et sa pathologie pulmonaire était moins grave, tandis que l'infection par Omicron a provoqué moins de perte de poids et de mortalité que la souche d'origine et les mutants Alpha, Beta et Delta.
Les chercheurs ont donc conclu que la réplication et la pathogénicité d’Omicron étaient réduites chez la souris.

Source de l'image Internet

Le 16 mai 2022, Nature a publié un article de Yoshihiro Kawaoka, un virologue de premier plan de l'Université de Tokyo et de l'Université du Wisconsin, confirmant pour la première fois dans un modèle animal qu'Omicron BA.2 est en effet moins virulent que la souche originale précédente.

Les chercheurs ont sélectionné des virus BA.2 vivants isolés au Japon pour infecter des souris et des hamsters k18-hACE2 et ont découvert qu'après infection avec la même dose de virus, les souris infectées par BA.2 et BA.1 avaient des titres viraux significativement plus faibles dans les poumons et le nez que l'infection par la souche New Crown d'origine (p<0,0001).

Ce résultat de référence confirme qu'Omicron est effectivement moins virulent que le type sauvage d'origine. En revanche, aucune différence significative n'a été observée dans les titres viraux dans les poumons et le nez des modèles animaux après les infections par BA.2 et BA.1.

Source de l'image Internet

Les tests de charge virale par PCR ont montré que les souris infectées par BA.2 et BA.1 avaient des charges virales plus faibles dans les poumons et le nez que la souche New Crown d'origine, en particulier dans les poumons (p < 0,0001).

Similaires aux résultats obtenus chez la souris, les titres viraux détectés dans le nez et les poumons des hamsters infectés par BA.2 et BA.1 étaient inférieurs à ceux de la souche d'origine après « inoculation » avec la même dose de virus, en particulier dans les poumons, et légèrement inférieurs dans le nez des hamsters infectés par BA.2 que BA.1 – en fait, la moitié des hamsters infectés par BA.2 n'ont pas développé d'infection pulmonaire.

Il a également été constaté que les souches originales, BA.2 et BA.1, manquaient de neutralisation croisée des sérums après l'infection, ce qui est cohérent avec ce qui a été observé chez des humains du monde réel lorsqu'ils étaient infectés par différents nouveaux mutants de la couronne.

Source de l'image Internet

Données réelles : Omicron est moins susceptible de provoquer des maladies graves

Plusieurs des études ci-dessus ont décrit la virulence réduite d’Omicron dans des modèles animaux de laboratoire, mais est-ce la même chose dans le monde réel ?

Le 7 juin 2022, l’OMS a publié un rapport évaluant la différence de gravité des personnes infectées lors de l’épidémie d’Omicron (B.1.1.529) par rapport à la pandémie Delta.

Le rapport inclut 16 749 nouveaux patients hospitalisés pour des maladies coronariennes dans toutes les provinces d'Afrique du Sud, dont 16 749 lors de l'épidémie du variant Delta (du 2 août 2021 au 3 octobre 2021) et 17 693 lors de l'épidémie d'Omicron (du 15 novembre 2021 au 16 février 2022). Les patients ont été classés comme sévères, graves et non graves.

critique : avoir reçu une ventilation invasive, ou de l'oxygène et de l'oxygène transnasal à haut débit, ou une oxygénation par membrane extracorporelle (ECMO), ou une admission en USI pendant l'hospitalisation.
-grave (sévère) : reçu de l'oxygène pendant l'hospitalisation
-non grave : si aucune des conditions ci-dessus n'est remplie, le patient est non grave.

Les données ont montré que dans le groupe Delta, 49,2 % des patients hospitalisés infectés par le virus Delta étaient graves, 7,7 % étaient critiques et 28 % sont décédés, tandis que dans le groupe Omicron, 28,1 % étaient graves, 3,7 % étaient critiques et 15 % sont décédés. De plus, la durée médiane de séjour était de 7 jours dans le groupe Delta, contre 6 jours dans le groupe Omicron.

En outre, le rapport a analysé les facteurs d’influence de l’âge, du sexe, du statut vaccinal et des comorbidités et a conclu qu’Omicron (B.1.1.529) était associé à une probabilité plus faible de maladie grave et critique (IC à 95 % : 0,41 à 0,46 ; p<0,001) et à un risque plus faible de décès à l’hôpital (IC à 95 % : 0,59 à 0,65 ; p<0,001).

Source de l'image Internet

Pour les différents sous-types d’Omicron, d’autres études ont également analysé en détail leur virulence.

Une étude de cohorte menée en Nouvelle-Angleterre a analysé 20 770 cas de Delta, 52 605 cas d'Omicron B.1.1.529 et 29 840 cas d'Omicron BA.2. Elle a constaté que la proportion de décès était de 0,7 % pour Delta, 0,4 % pour B.1.1.529 et 0,3 % pour BA.2. Après ajustement pour tenir compte des facteurs de confusion, l'étude a conclu que le risque de décès était significativement plus faible pour BA.2 que pour Delta et B.1.1.529.

Source de l'image Internet

Une autre étude menée en Afrique du Sud a évalué le risque d'hospitalisation et le risque de complications graves pour les variants Delta, BA.1, BA.2 et BA.4/BA.5. Les résultats ont montré que sur les 98 710 patients nouvellement infectés inclus dans l'analyse, 3 825 (3,9 %) ont été hospitalisés, dont 1 276 (33,4 %) ont développé une forme grave de la maladie.

Français Parmi les personnes infectées par les différentes mutations, 57,7 % des patients infectés par Delta ont développé une maladie grave (97/168), contre 33,7 % des patients infectés par BA.1 (990/2940), 26,2 % de BA.2 (167/637) et 27,5 % de BA.4/BA.5 (22/80). L'analyse multivariée a montré que la probabilité de développer une maladie grave parmi les personnes infectées par Delta > BA.1 > BA.2, tandis que la probabilité de développer une maladie grave parmi les personnes infectées par BA.4/BA.5 n'était pas significativement différente par rapport à BA.2.
Virulence réduite, mais vigilance nécessaire

Des études en laboratoire et des données réelles provenant de plusieurs pays ont montré qu’Omicron et ses sous-types sont moins virulents et moins susceptibles de provoquer une maladie grave que la souche originale et d’autres souches mutantes.

Français Cependant, un article de synthèse paru dans le numéro de janvier 2022 de The Lancet, intitulé « Plus doux mais pas doux », a noté que bien que l'infection à Omicron représentait 21 % des admissions à l'hôpital dans la population sud-africaine plus jeune, la proportion d'épidémies provoquant une maladie grave était susceptible d'augmenter dans les populations ayant des niveaux d'infection et des niveaux de vaccination différents. (Néanmoins, dans cette population sud-africaine généralement jeune, 21 % des patients hospitalisés infectés par le variant omicron du SRAS-CoV-2 ont eu une issue clinique grave, une proportion qui pourrait augmenter et avoir un impact substantiel lors d'épidémies dans des populations ayant des caractéristiques démographiques différentes et des niveaux plus faibles d'immunité dérivée de l'infection ou du vaccin.)

Français À la fin du rapport de l'OMS susmentionné, l'équipe a noté que malgré la virulence réduite de la souche précédente, près d'un tiers des patients hospitalisés atteints d'Omicron (B.1.1.529) ont développé une forme grave de la maladie, et que les divers nouveaux mutants couronne continuaient de provoquer une morbidité et une mortalité élevées chez les personnes âgées, les personnes immunodéprimées ou les personnes non vaccinées. (Nous tenons également à souligner que notre analyse ne doit pas être considérée comme un soutien au récit d'une variante « légère ». Près d'un tiers des patients hospitalisés atteints d'Omicron ont développé une forme grave de la maladie et 15 % sont décédés ; des chiffres qui ne sont pas négligeables… Parmi les populations vulnérables, c'est-à-dire les patients aux âges extrêmes, dans les populations présentant une charge de comorbidité élevée, chez les patients fragiles et parmi les personnes non vaccinées, la COVID-19 (tous les VOC) continue de contribuer à une morbidité et une mortalité substantielles.)

Les données précédentes d'Omicron, lorsqu'elle a déclenché la cinquième vague de la pandémie à Hong Kong, ont montré qu'au 4 mai 2022, il y avait eu 9 115 décès sur 1 192 765 nouveaux cas au cours de la cinquième vague (un taux de mortalité brut de 0,76 %) et un taux de mortalité brut de 2,70 % pour les personnes de plus de 60 ans (environ 19,30 % de cette tranche d'âge n'étaient pas vaccinées).

En revanche, seulement 2 % des Néo-Zélandais de plus de 60 ans ne sont pas vaccinés, ce qui est fortement corrélé à un faible taux de mortalité brut de 0,07 % pour la nouvelle épidémie de couronne.

D’un autre côté, alors qu’il est souvent avancé que la maladie de Newcastle pourrait devenir une maladie saisonnière et endémique à l’avenir, certains experts universitaires ont un point de vue différent.

Trois scientifiques de l'Université d'Oxford et du Centre commun de recherche de l'Union européenne estiment que la gravité moindre d'Omicron pourrait simplement être une coïncidence, et qu'une évolution antigénique rapide et continue (évolution antigénique) pourrait entraîner de nouvelles variantes.

Contrairement à l'échappement immunitaire et à la transmissibilité, qui sont soumis à une forte pression évolutive, la virulence n'est généralement qu'un « sous-produit » de l'évolution. Les virus évoluent pour maximiser leur capacité de propagation, ce qui peut également entraîner une augmentation de leur virulence. Par exemple, en augmentant la charge virale pour faciliter la transmission, ils peuvent néanmoins provoquer une maladie plus grave.

De plus, la virulence ne causera que des dommages très limités lors de la propagation d’un virus si les symptômes provoqués par le virus apparaissent principalement plus tard dans l’infection – comme dans le cas des virus de la grippe, du VIH et de l’hépatite C, pour n’en citer que quelques-uns, qui ont beaucoup de temps pour se propager avant de provoquer de graves conséquences.

Source de l'image Internet

Dans de telles circonstances, il peut être difficile de prédire la tendance de la nouvelle souche mutante de la couronne à partir de la virulence plus faible d’Omicron, mais la bonne nouvelle est que le nouveau vaccin de la couronne a démontré un risque réduit de maladie grave et de décès contre toutes les souches mutantes, et l’augmentation agressive des taux de vaccination de la population reste un moyen important de lutter contre l’épidémie à ce stade.
Remerciements : Cet article a été révisé professionnellement par Panpan Zhou, PhD, École de médecine de l'Université Tsinghua et chercheur postdoctoral, Scripps Research Institute, États-Unis.
Réactif antigénique d'auto-test Omicron à domicile